どれもセルフホストなら無料。

Outline – Team knowledge base & wiki
https://www.getoutline.com/

がっつりNotionライクで、使いやすそう。

SiYuan – Markdown,ブロックレベル参照,双方向リンクをサポートするプライバシー第1のナレッジ管理システム
https://b3log.org/siyuan/en/

おそらくVScodeベースのUI。

Obsidian – Sharpen your thinking
https://obsidian.md/

老舗でプラグインなども多く、完成度が高いが、無料セルフホストではWebUIが使えない。またアプリ起動が少し遅い。

The Everything App
https://anytype.io/

非常に美しいUI。Obsidiaん同様、サーバーホストではんくローカルアプリの保存フォルダをクラウドで同期する形式。動作は軽いが、Obsidianほど拡張性はない。